1.此发现是人类自2000年以来首次识别出 HIV-1 病毒的新亚型。
2.雅培正将此新病毒株提供给研究人员，从而评估其对诊断测试、治疗和潜在疫苗的影响。
人类免疫缺陷病毒（HIV）的新亚型病毒
2019年11月6日，雅培公司宣布，其科学家团队发现了一种人类免疫缺陷病毒（HIV）的新亚型病毒，称为M组HIV-1，亚型L【1】。该发现已于11月6日在《获得性免疫缺陷综合症杂志》（JAIDS）发表，凸显了下一代测序技术在帮助研究人员领先一步应对变异病毒、避免新流行病爆发方面发挥的作用。
自艾滋病在全球范围内爆发以来，已有7500万人感染HIV病毒，如今仍有3790万人携带HIV病毒【2】。经过全球卫生界过去几十年的努力，终结艾滋病毒的大规模传播已成为可能。但研究人员仍然必须继续监测新的菌株，以确保相应的检测和治疗手段仍然奏效。
“在这个联系日益紧密的世界，病毒不会如我们想象的那样只局限于一个地方。”研究作者之一、密苏里大学堪萨斯分校口腔学院教授Carole McArthur博士表示：“这一发现提醒我们，为了终结HIV病毒的流行，我们必须更有前瞻性，要利用最新的技术和资源来充分了解病毒。”
这项研究标志着自2000年HIV病毒株分类指南制定以来，人类首次发现“M组”HIV病毒的新亚型病毒。M组病毒是全球传播最广的艾滋病病毒，来源于撒哈拉以南非洲的刚果民主共和国（DRC）【3-4】。
发现新病毒基因测序背后的科学
为确定一种不寻常的病毒是否真的为HIV新型亚型病毒，研究人员必须发现3个单独的病例【5】。该亚型病毒的前2个样本于20世纪80年代和90年代在刚果民主共和国被发现。2001年，第3个样本被采集到，但当时并没有可对其进行基因测序的病毒数量和技术。
如今，下一代测序技术让研究人员能够以更快的速度和更低的成本对基因组进行测序。为了利用这项技术，雅培公司的科学家们必须开发和应用新技术，以缩小样本中病毒部分的范围，从而全面完成基因组测序【6】。
“识别这样的新病毒就如同大海捞针。”雅培诊断业务全球病毒监测计划的负责人、首席科学家兼研究作者之一的Mary Rodgers博士说：“将新方法与下一代测序技术相结合，我们就能拥有进行‘大海捞针’的‘磁铁’。这一科学发现可帮助我们及时阻止新的流行病爆发。”
1.Yamaguchi J, Vallari A, McArthur C, Sthreshley L, Cloherty G, Berg M, Rodgers MA. Complete genome sequence of CG-0018a-01 establishes HIV-1 subtype L. Journal of Acquired Immune Deficiency Syndromes. 2019; https://journals.lww.com/jaids/Abstract/publishahead/Complete_genome_sequence_of_CG_0018a_01.96307.aspx.
2.Global health observatory (GHO) data: HIV/AIDS. World Health Organization. https://www.who.int/gho/hiv/en/
3.Worobey M, Gemmel M, Teuwen DE, et al. Direct evidence of extensive diversity of HIV-1 in Kinshasa by 1960. Nature. 2008;455(7213):661-664.
4.Faira NR, Rambaut A, Suchard MA, et al. HIV epidemiology. The early spread and epidemic ignition of HIV-1 in human populations. Science. 2014;346(6205):56-61.
5.Robertson DL, Anderson JP, Bradac JA, et al. HIV-1 nomenclature proposal. Science. 2000;288(5463):55-56.
6.Yamaguchi J, Olivo A, Laeyendecker O, Forberg K, Ndembi N, Mbanya D, Kaptue L, Quinn TC, Cloherty GA, Rodgers MA, Berg MG. Universal target capture of HIV sequences from NGS libraries. Frontiers Micro. 2018; 9(2150): 1-13.
点击以下链接获取文献《CG-0018a-01完整基因组序列确认了HIV-1亚型病毒L（Complete genome sequence of CG-0018a-01 establishes HIV-1 subtype L）》
https://journals.lww.com/jaids/pages/default.aspx
